Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POU5F1Q01860 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms