Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms