Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA6Q01524 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms