Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms