Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5Q00535 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5Q00535 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms