Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms