Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EEF1A1P68104 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms