Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms