Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS3AP61247 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms