Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB5BP61020 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB5BP61020 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB5BP61020 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB5BP61020 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB5BP61020 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB5BP61020 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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