Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ERVFC1-1P60608 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ERVFC1-1P60608 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms