Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN2P57739 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms