Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACLYP53396 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACLYP53396 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACLYP53396 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACLYP53396 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACLYP53396 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms