Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HK3P52790 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HK3P52790 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HK3P52790 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HK3P52790 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HK3P52790 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HK3P52790 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HK3P52790 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HK3P52790 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms