Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCR4P51679 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCR4P51679 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCR4P51679 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCR4P51679 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms