Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP4P49662 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP4P49662 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms