Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GRIA4P48058 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms