Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP2P42575 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms