Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATP6V1E1P36543 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms