Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms