Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms