Protein–RNA interactions for Protein: P30520

ADSS, Adenylosuccinate synthetase isozyme 2, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADSSP30520 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ADSSP30520 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ADSSP30520 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ADSSP30520 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ADSSP30520 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ADSSP30520 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ADSSP30520 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ADSSP30520 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ADSSP30520 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms