Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NMBRP28336 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NMBRP28336 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NMBRP28336 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NMBRP28336 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NMBRP28336 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NMBRP28336 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NMBRP28336 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NMBRP28336 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NMBRP28336 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms