Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms