Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTX3P26022 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTX3P26022 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTX3P26022 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTX3P26022 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms