Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HRCP23327 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HRCP23327 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HRCP23327 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HRCP23327 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HRCP23327 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HRCP23327 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HRCP23327 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HRCP23327 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HRCP23327 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms