Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGFR4P22455 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms