Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2P22307 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2P22307 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2P22307 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2P22307 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2P22307 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2P22307 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2P22307 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCP2P22307 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCP2P22307 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCP2P22307 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCP2P22307 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms