Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFNA1P20827 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms