Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB1P20618 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms