Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOLR1P15328 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms