Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNNT1P13805 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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