Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DMDP11532 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DMDP11532 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DMDP11532 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DMDP11532 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DMDP11532 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DMDP11532 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DMDP11532 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DMDP11532 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DMDP11532 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DMDP11532 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DMDP11532 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DMDP11532 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DMDP11532 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DMDP11532 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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