Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBL4AP11441 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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