Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F13BP05160 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
F13BP05160 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
F13BP05160 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms