Protein–RNA interactions for Protein: O75871

CEACAM4, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM4O75871 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CEACAM4O75871 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM4O75871 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM4O75871 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms