Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 CHST12-203ENST00000432336 921 ntTSL 213.6□□□□□ -0.234e-6■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 STIM2-209ENST00000494628 726 ntTSL 513.49□□□□□ -0.254e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 RHOC-209ENST00000414971 470 ntTSL 313.43□□□□□ -0.264e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 TKT-207ENST00000461139 1972 ntTSL 213.38□□□□□ -0.276e-9■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 SMAD3-214ENST00000560402 590 ntTSL 412.98□□□□□ -0.331e-11■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.366e-9■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 TKT-206ENST00000460343 7286 ntTSL 212.34□□□□□ -0.436e-9■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.434e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 SMAD3-202ENST00000439724 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.471e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.486e-9■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 SMAD3-205ENST00000558428 554 ntTSL 411.74□□□□□ -0.531e-11■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 SCN9A-205ENST00000454569 1585 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.686e-9■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 MORC2-201ENST00000215862 4469 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.754e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 TMEM9-207ENST00000455367 487 ntTSL 510.29□□□□□ -0.764e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 ITGB5-203ENST00000461306 577 ntTSL 410.29□□□□□ -0.761e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.876e-9■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 CRIP3-201ENST00000274990 800 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -14e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 SMAD3-203ENST00000537194 1147 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.041e-11■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.24e-6■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 UGDH-209ENST00000510881 549 ntTSL 35.48□□□□□ -1.534e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.216e-8■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 PSME2-214ENST00000560592 760 ntTSL 211.34□□□□□ -0.592e-10■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 PSME2-211ENST00000559613 300 ntTSL 32.61□□□□□ -1.992e-10■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.58e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.149e-7■□□□□ 11.3
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PRPF4O43172 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.237e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.27e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NDRG2-271ENST00000557353 1919 ntTSL 216.27■□□□□ 0.197e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.187e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.177e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.167e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.147e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.117e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.067e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NDRG2-258ENST00000556716 2718 ntTSL 214□□□□□ -0.177e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.187e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 NDRG2-274ENST00000557633 527 ntTSL 311.21□□□□□ -0.617e-11■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.62e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.062e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 SETD5-202ENST00000399686 3362 ntTSL 57.7□□□□□ -1.182e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 13e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 CYP27A1-205ENST00000494263 2566 ntTSL 218.96■□□□□ 0.633e-6■□□□□ 11.3
PRPF4O43172 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.91□□□□□ -0.029e-8■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 COMT-208ENST00000428707 724 ntTSL 313.32□□□□□ -0.287e-7■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 TAF1D-205ENST00000526015 1735 ntTSL 1 (best)19.03■□□□□ 0.641e-9■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.291e-9■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 TAF1D-207ENST00000527169 1127 ntTSL 516.82■□□□□ 0.281e-9■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 TAF1D-216ENST00000532235 334 ntTSL 315.29■□□□□ 0.041e-9■□□□□ 11.2
PRPF4O43172 TAF1D-217ENST00000532455 565 ntTSL 415.1■□□□□ 0.011e-9■□□□□ 11.2
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