Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms