Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2F3O00716 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms