Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms