Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms