Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SRRM4A7MD48 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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