Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms