Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms