Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RAPGEF2Q9Y4G8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAPGEF2Q9Y4G8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAPGEF2Q9Y4G8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAPGEF2Q9Y4G8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms