Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SHOC2Q9UQ13 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms