Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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