Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEFF2Q9UIK5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms