Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCN11AQ9UI33 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms