Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MED13Q9UHV7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms